地下水污染方式可分為直接污染和間接污染兩種。直接污染的特點是污染物直接進入含水層，在污染過程中，污染物的性質不變。這是對地下水污染的主要方式。間接污染的特點是，地下水污染并非由于污染物直接進入含水層引起的，而是由于污染物作用于其他物質，使這些物質中的某些成分進入地下水造成的。例如，由于污染引起的地下水硬度的增加、溶解氧的減少等。間接污染過程復雜，污染原因易被掩蓋，要查清污染來源和途徑較為困難。

進入地下水的污染物有來自人類活動的，有來自自然過程的。

1. 生活污水和生活垃圾會造成地下水的總礦化度、總硬度、硝酸鹽和氯化物含量的升高，

  有時也會造成病原體污染。

2. 工業廢水和工業廢物可使地下水中有機和無機化合物的濃度增加。

3. 農業施用的化肥和糞肥，會造成大范圍的地下水硝酸鹽含量增高。農藥對地下水的污染

  較輕，且僅限于淺層。農業耕作活動可促進土壤有機物的氧化，如有機氮氧化為無機氮

 （主要是硝態氮），隨滲水進入地下水。天然的咸水會使地下天然淡水受咸水污染等。

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